InterViewer蛋白質結構分析軟件是生物信息工程中最基本也是最重要的數據之一 -,通常都需要使用專業的繪圖工具InterViewer才能夠處理。蛋白相互作用網絡經常包括數千或更多節點的,這嚴重地限制了許多圖表的繪圖工具的實用性,因為他們成為網絡的交互式anal- ysis太慢,因為它們產生混亂附圖與許多邊交叉。我們提出了一個新的,非??焖俚牟季炙惴捌鋵崿F,叫做InterViewer3可視化大規模的蛋白質相互作用網絡。
使用方法
(1)首先找到整個網絡的連接的部件的布局,
(2)發現與所連接的組件中相對于樞軸節點的節點的全球布局,
(3)細化每個被連接成分的由第一重新定位的本地布局midnodes就其cutvertices和cutvertices的直接鄰國,然后通過重新定位的所有節點相對于他們的鄰居在距離2的優勢
圖形繪制方法:
(1)這是一個數量級的速度更快,
(2 )它可以直接可視化從蛋白質相互作用數據庫中的數據
(3)它提供了幾個操作為有效探索大規模蛋白相互作用網絡。